課程資訊
課程名稱
蛋白質體學入門
Proteomics for Beginners 
開課學期
109-2 
授課對象
醫學院  基因體暨蛋白體醫學研究所  
授課教師
潘思樺 
課號
Genom7013 
課程識別碼
455 M0130 
班次
 
學分
1.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期二6,7(13:20~15:10) 
上課地點
基醫504 
備註
本課程中文授課,使用英文教科書。與吳欣怡、辜韋智、朱俐潔等老師合開。與戴桓青、林妙霞、邱繼輝合授
總人數上限:30人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1092Genom7013_Pro 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

待補進入後基因時代,生物醫學的各項研究開始著重在探討各類基因所具有的功能、表現及其調控;其中蛋白質又被認為是生物體內實際執行這些生理功能的主要物質。而隨著質譜技術與生物資訊學的演進,蛋白質體學(Proteomics)已成為現階段一項重要的研究技術,透過大規模的分析,不僅可以讓研究人員在極短的時間內,將分析樣本中的蛋白質身份加以鑑定;同時,藉由不同分析樣本的相互比較 (如疾病組織與正常組織或是藥物治療前後),也能讓研究人員透過這些樣本間蛋白表現的差異,進而瞭解與疾病或是不同生理調控有關的訊息傳遞與相關作用機轉。本課程將針對蛋白質體學的基本原理、實驗設計、樣本製作與結果分析做系列性的介紹,以使同學能對蛋白質體研究技術有一初步的認識與了解。 

課程目標
透過此課程循序漸進的帶領同學了解在執行蛋白質體學研究時,相關實驗設計,樣本前處裡,資了結果分析以及最終實驗結果的解讀能有系列性的了解。同時也將配合討論的方式,進一步了解並回覆同學們對於蛋白質體學研究相關的各項疑問。 
課程要求
本課程因包含研究設計與資料處哩, 是以若選修人數過多時會優先開放碩博士生選讀。 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
備註: 40% Paper and Group discussion、30% 參與討論的狀況、30% 上課出席率 
指定閱讀
待補 
參考書目
待補 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/23  Class Introduction 
第2週
3/02  Experimental design for Qualitative Proteomics 
第3週
3/09  Experimental design for Quantitative Proteomics 
第4週
3/16  Sample preparation and protein identification 
第5週
3/23  Qualitative Proteomics 
第6週
3/30  Mass spectrometry (I) 
第7週
4/06  春假 
第8週
4/13  Mass spectrometry (II) 
第9週
4/20  Fundamentals of Quantitative Proteomics: Precursor Ion-Based Quantitation 
第10週
4/27  Fundamentals of Quantitative Proteomics: Isobaric Labeling-Based Quantitation and Selected Reaction Monitoring 
第11週
5/04  Introduction and principle of phosphoproteomics analysis 
第12週
5/11  Application of phosphoproteomics analysis 
第13週
5/18  Glycoproteomics (I) 
第14週
5/25  Glycoproteomics (II) 
第15週
6/01  Introduction of databases and web tools for proteomics analysis 
第16週
6/08  Application of proteomics in clinical research 
第17週
6/15  Laboratory visiting and discussion